首先，要给千眼菩提子去皮，这时候应该选择100目的砂纸；去完皮后，就需要换240目的砂纸打磨，直至花纹略微显现；然后再换800目的砂纸打磨到花纹清晰为止。接下来，需要用1200目的砂纸给千眼菩提子粗略抛光。最后，就是换2000目的砂纸打磨，使千眼菩提子表面极致抛光。需要注意的是，一开始打磨千眼菩提子的时候是可以沾水的，但在抛光的时候，最好还是不要沾水。在后期的盘玩过程中，不要让千眼菩提子沾水。
